植物系统与进化研究组是在中国科学院昆明植物所海外引进人才启动项目资助下，由伊廷双博士于2006年组建的研究团队。主要从事以下3个方面的研究。
1. 植物系统发育基因组学
利用核、叶绿体和线粒体系统发育基因组学方法重建种子植物，特别是固氮分支及分支内蔷薇科、豆科、鼠李科、大麻科等类群的生命之树，揭示主要支系和属种的分类范畴，系统发育关系，并在系统发育框架下探讨三个基因组的进化机制。
2. 植物多样化形成和维持机制
根据构建的系统发育树，结合古地质、古气候和化石证据推断类群的起源、分化和现在分布格局形成的历史；研究物种多样化的限制和驱动因子；探讨植物性状演化式样。
3. 智能植物志“iFlora”
中国维管植物“iFlora”平台构建。对固氮分支及该分支内的豆科、蔷薇科、鼠李科、大麻科等类群开展DNA条形码和组学数据为主的超级条形码（ultra-barcoding）研究。
